RCSB PDB

RCSB PDB

探索蛋白质与核酸的三维结构RCSB PDB提供来自PDB档案的实验测定三维结构、整合三维结构,以及来自AlphaFold DB和ModelArchive的计算结构模型。用户可以按序列、结构和功能注释进行简单或高级搜索,并对分子进行可视化、下载和分析。

RCSB PDB 页面快照
258,222
实验测定PDB结构
394
整合PDB结构
82,833
含人类序列的结构
22,212
含核酸的结构
核心能力

从结构数据检索到分析的一体化工具

围绕PDB结构数据,RCSB PDB提供检索、可视化、结构分析、文件下载、程序化访问和数据学习等功能。

多维结构搜索

支持高级搜索、序列相似性搜索、三维相似性搜索和化学相似性搜索,可按结构注释、序列、形状及化学信息检索。

分子三维可视化

Mol*(MolStar)用于可视化PDB结构和配体结合位点,可从结构摘要页面进入。

结构分析工具

提供成对结构比对、对称性资源、结构质量、结构分组和生物组装分析等工具。

结构与实验数据下载

可批量下载坐标、实验数据、FASTA序列、配体SDF文件及其他PDB相关数据文件。

Web APIs程序化访问

提供Data API和Search API,用于以程序方式访问RCSB PDB数据与搜索能力。

近期动态

结构档案与科研教育资源更新

页面公开展示结构档案变更、工具更新、网络研讨会和PDB-101教育内容。

夏季通讯发布

内容介绍扩展PDB ID、RCSB.org预测计算结构模型更新,以及用于探索蛋白质结构域的PDB-101资源。

探索整合结构的网络研讨会

研讨会介绍如何使用RCSB.org工具探索通过整合与混合方法测定的PDB结构。

PDB Beta Archive过渡计划

页面说明将采用扩展PDB ID、PDBx/mmCIF格式和新的PDB档案目录结构,并建议用户提前使用Beta Archive。

学习与数据资源

连接数据、工具与学习材料

通过数据指南、培训课程、分子月刊、教育资源和程序化接口,了解PDB数据并开展结构研究。

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从这里开始使用RCSB PDB。